Me sucede muchas veces cuando la mob se 'buguea' y queda con 0 HP, el homúnculo intenta atacar pero como no hay ningún target válido, tira ese error.
Si te sucede en BG/PVP, lo mas probable sea porque el PJ te aparece con lag posicional, y tendrás que utilizar @refresh cuando notes eso (tedioso, pero no he encontrado otra solución xD), antes de que te tire el pop-up.
Probablemente se deba a que estás usando el Thoth AI, si el homúnculo ataca a alguien en BG ese pj es guardado en una lista en tu carpeta de AI y cada vez que el homúnculo lo vea éste le atacará, en city al no poder targetear a otros jugadores digamos que sale ese error.
Para resetear dicha lista de personas creo que era sentándote y usando varias veces el atajo de agresivo/pasivo del homúnculo hasta que te salga un cartel.