¿volviste a apretar el boton de Stand by? Porque, o se pone pasivo o activo el homunculo.
En Ajustes de BM, en la ultima columna de la derecha, dice "homun comandd" o algo así, podes poner ALT + T(o letra que te guste), para poner Pasivo/activo al homunculo sin la necesidad de apretar botón derecho sobre el homun,
¿cargaste el /hoai después de que se te puso pasivo el homunculo o fue después? Porque según el AI esta activado para que les pegue automáticamente. ¿tu homun es level muy bajo? Intenta pegarles vos primero y que después le pegue el homun. (es raro porque dijiste que pegaba solo).