Si, es totalmente al azar. Tu subes al homúnculo que va muy bien y de repente llega un nivel en el que ya no sube más int, entonces procedes a borrarlo si es que no va dentro del límite para que se pueda recuperar. Lo mejor es que el homúnculo empiece con mucha int, ya que si le va sobrando, en caso de que se quede algunos niveles sin subir nada de int, pueda recuperarse y no haya que borrarle. Hay un muy bajo porcentaje de que te salga uno excelente y la mayoría son normales.
No interfiere en nada si se muere o no. Si quieres ir controlando cuanta int va subiendo desde que nace puedes hacer @hominfo y te dará los estados que tiene hasta ahora.