Para entrar por la parte de las tuberías tienes que hacer la quest, no llega solo con tener el Laboratory Permit.
Para entrar sin quest necesitas Geek Glasses y Grampa Beard, vas a donde se hace la quest de los embryos y nada más pasar por el primer warp ves a la izquierda un npc llamado Regenschirm Guard, hablas con él (con el Laboratory Permit equipado), le das a "Yes" y apareces en el primer piso de Bio.